升级限制主要体现为基地等级、舰船技术值上限以及赛季重置机制。基地等级是核心限制，每级基地解锁的建筑、舰船生产权限和计划圈数量均有硬性门槛，例如2本需主力舰生产线4级、仓库4级、通用港口3级，而速升4本需优先升级实用建筑如资源合成工厂。技术值则通过战斗或开箱获取，用于强化舰船性能，但单舰技术值存在50级上限（战斗数据）或30级（海盗野怪经验），超过后需依赖玩家对抗或氪金突破。赛季重置会清空基地等级、资源及部分蓝图进度，但保留技术储备和开箱技能点，形成周期性成长循环。
资源采集效率直接影响升级速度，但存在动态平衡机制。工程船采集受矿点储量、等级及对接方式制约，例如小型矿船（1本）仅能采集LV2以下资源点，而大型矿船（8本）需40指挥值但效率翻倍。矿点连接后虽提升产量但禁止采集，导致金属紧缺时需权衡对接与手动采集的收益。计划圈摆放技巧（如边缘定位）和矿队搭配（AC721运载舰+工程船）能优化采集效率，但计划圈总数受基地等级限制，初期仅2个，需合理分配于采矿、战斗和扩张。
舰船升级存在隐性天花板，不同获取途径的经验值互不叠加。海盗野怪经验仅支持0-30级，开箱战斗数据可升至50级，而玩家对抗无等级限制但耗时较长。技术值分配需遵循舰船定位，例如战巡优先装甲系统，侦察舰强化动力系统。部分高级舰船如航母、战巡因指挥值消耗过高，通常需通过增援功能突破编队限制，但增援会导致曲速航行失效，需谨慎使用。
赛季机制是全局性升级限制，每赛季约70天，结束时星门建造完成即触发重置。重置后玩家需从1本重新发育，但技术储备、未使用的动员令及部分协议进度可继承。这种设计迫使玩家在赛季中后期转向PVP或特殊玩法（如哨所挑战），而速本策略（如护肝流3天到4本）能缩短发育真空期。游戏的升级限制并非绝对，而是通过资源、时间和社交协作的多重维度形成策略深度。
